发酵罐主要应用于三个领域：食物工业、医药工业、环境科学。在食物工业上，发酵罐常用于三大类商品，一是出产传统的发酵商品，如啤酒、果酒、食醋等;二是出产食物添加剂;三是协助解决粮食疑问。
在医药工业上，根据发酵工程技能，开发了品种繁复的药品，如人类生长激素、重组乙肝疫苗、某些品种的单克隆抗体、白细胞介素-2、抗血友病因子等。在环境科学上，主要应用于污水处理中微生物的强化。微生物发酵的兴起带动发酵罐需求的增加，在科技的前进中发酵罐的效果在不断改变，不仅提高了安全性，也逐渐深入到人们的日常生活中。
为了保证安全性，发酵罐有着严格的要求。其结构需严密，要经得起蒸汽的反复灭菌。此外，内壁还需光滑，不锈钢发酵罐，耐腐蚀性能也应具备，这样才能有利于彻底灭菌，减小金属离子对生物反应的影响。优质的发酵罐要有良好的气、液、固接触和混合性能，有与高效的热量、质量、动量传递性能;在保持生物反应要求的前提下，降低发酵罐能耗;有良好的热量交换性能，以维持生物反应的最适温度
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